De havo (hoger algemeen voortgezet onderwijs) duurt 5 jaar en bereidt leerlingen voor op een studie in het hoger beroepsonderwijs (hbo). Deze afdeling bouwt voort op wat in leerjaar 1 en 2 in de dakpanklassen is geleerd aan kennis en vaardigheden. Het onderwijs in de havo richt zich op de havoleerling die over het algemeen goed in staat is om te leren, maar daarbij ook graag praktisch te werk gaat. Het onderwijs in de derde klas is een voorbereiding op de tweede fase (de vierde en vijfde klas) en is daarom gericht op het vergroten van de zelfstandigheid en het verwerven van een actief leervermogen. Ook leren de leerlingen meer over wie ze zijn of willen worden, wat ze goed kunnen, graag doen en willen gaan doen na de havo. Dit is nodig om goede keuzes te maken. De eerste keuze is de profielkeuze in leerjaar 3. In leerjaar 5 kiezen de leerlingen voor een opleiding of andere invulling na de havo. Leerjaar 5 wordt afgesloten met schoolexamens en het Centraal Examen, waarna hopelijk het havodiploma in ontvangst mag worden genomen.
Het leren op de havo over vakinhoud, jezelf en jezelf in relatie tot de ander en de omgeving doe je niet alleen. Samen met klasgenoten, docenten, mentoren, leerlingcoördinator, decaan en alle medewerkers op het Edith Stein College wordt ervoor gezorgd dat je kunt leren, zo dat je na 5 jaar kunt zeggen: Mooi, ik heb het waargemaakt.